இரண்டு ஆண்டுகளுக்கு பிறகு அவர் கோயிம்ப்ரா அனுப்பப்பட்டது. அங்கே அவர் பின்னர் பிரான்சிஸ்கன் பார்வை இணைந்து என்று அகஸ்டைனிய இறையியல் கற்றல், ஆராய்ந்து ஒன்பது ஆண்டுகளுக்கு தொடங்கியது. பெர்னாண்டோ ஒருவேளை இந்த நேரத்தில் ஒரு பூசாரி விதிக்கப்பட்டுள்ளது.
முதல் ஐந்து பிரான்சிஸ்கன் தியாகிகளின் உடல்கள் மொரோக்கோ திரும்பி வந்த போது இளம் பூசாரி வாழ்வில் ஒரு முக்கியமான திருப்பத்தை எடுத்தது. அவர்கள் செவில்லேயில் மசூதி, கிட்டத்தட்ட ஆரம்பத்தில் உயிர்த்தியாகம் வருகின்றன போதித்தார், ஆனால் சுல்தான் அவர்களுக்கு அங்கு, மீண்டும் மீண்டும் எச்சரிக்கை போதிலும் கிறிஸ்து தொடர்ந்து அறிவிப்பதன் பிறகு, அவர்கள் சித்திரவதை செய்யப்பட்டு, வெட்டினார் மொரோக்கோ, மீது கடந்து அனுமதி. இப்போது, ராணி மற்றும் ஒரு பெரிய கூட்டத்தை முன்னிலையில், தங்கள் எஞ்சியுள்ள மனப்பூர்வமான ஊர்வலமாக பெர்னாண்டோ மடாலயம் கொண்டு செல்லப்பட்டன
அவர் சந்தோஷம் மற்றும் ஒரு முக்கியமான முடிவை ஈர்க்கப்பட்டு. அவர் கோயிம்ப்ரா சிறிய friary சென்று, "அண்ணா, நான் மகிழ்ச்சியுடன் உங்கள் ஆணை பழக்கம் நீங்கள், Saracens தேசத்திற்கும் விரைவில் என்னை அனுப்ப சத்தியம் என்றால், நான் கிரீடம் பெறலாம் என்று வைத்து கூறினார் புனித தியாகிகள். "Augustinians முன் சில சவால்களை பிறகு, அவர் பெயர் அந்தோணி எடுத்து, அந்த துறவி மடம் விட்டு பிரான்சிஸ்கன் பழக்கம் பெற அனுமதி இருந்தது.